在 iPhone 6s 上，苹果公司将后置摄像头的像素增加到 1200 万。但苹果和 Android 以及 Windows Phone 阵营不一样，不止是单纯地增加摄像头像素，真正拍摄出来的照片质量完全没有提升，他们还从其他方面进行了提升。
iPhone 6s 和 iPhone 6s Plus 还保留着 iPhoe 6 上的 Focus Pixels
相位差对焦技术。加入相位差对焦后，对焦速度有一倍的提升。同时加入深沟槽隔离（Deep Trench
Isolation）技术透过替代成本高、占用面积大的结点隔离（Junction Isolation）技术，使模拟高压部件的尺寸大幅缩小。
另外内置在 A9 处理器中的图像信号处理器在降噪方面也有所提升，在消除噪点的同时能够保留更多细节和纹理。在很多竞争对手的相机手机中，他们使用的是比较简单的成像系统，细节和纹理通畅都是非常模糊的。
