手动聚焦和手动模式是两个概念。
手动聚焦指的是在任何模式下均需要手动以完成聚焦的操作，通常这种情况下相机不会提供合焦指示（在D90取景器里，不会出现绿灯，当然就更不会闪烁）。还有一种情况，就是在全时手动镜头中，以自动聚焦方式操作的时候，也可以旋转聚焦环以精确聚焦——当然，如果不能确定机器上的镜头是全是手动的，最好不要这样操作。只有在自动聚焦的时候，取景器里才会显示合焦指示绿灯，在D90中，必须是镜头的聚焦模式钮和机身的聚焦模式钮都处于AF，才能进行自动聚焦，有一个不是就不行。纯手动聚焦模式下，无论是否合焦都能曝光拍照。
手动模式，指的是光圈、快门、曝光补偿（包括是否打开内闪）、ISO都必须手动设定，但聚焦模式并不包括在内。
